Da Kaninchen bereits im Alter von 3 Monaten geschlechtsreif sind, ist es nützlich, Weibchen von Männchen frühzeitig zu trennen, besonders um Inzucht zu vermeiden. Am einfachsten lässt sich ein erwachsenes, männliches Kaninchen bestimmen, aber bei Kaninchen kann man in jedem Alter die Geschlechter unterscheiden.

Um zwischen männlichen und weiblichen Kaninchen zu unterscheiden muss man die Kaninchen auf den Rücken drehen, so dass man sich die Geschlechtsteile genauer ansehen kann. Am besten bittet man eine zweite Person, dass Kaninchen still zu halten.
Bei männlichen Kaninchen erkennt man deutlich die Hodensäcke zwischen den Hinterläufen. Die Hodensäcke sind nur mit Haut bedeckt, sind aber gelegentlich zwischen dem Fell des Kaninchens versteckt.
Bei sehr jungen Kaninchen oder Weibchen muss man die Genitalöffnung überprüfen. Unter der Blume (dem Stummelschwänzchen) sucht man nach Hautfalten. Die Falten spreizt man auseinander, um die Genitalöffnung und den After zu sehen. Beim Weibchen ist der After näher an der Blume.
Es kommt vor, dass die Schamlippen bei Weibchen heraustreten und mit den Hoden des Männchens verwechselt werden. Bei Zweifel muss man nach der Scheidenöffnung suchen.

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